德克薩斯大學(xué)MD安德森癌癥中心的研究人員開發(fā)了首個用于單細胞DNA測序的突變檢出程序,Monovar。這一重要成果發(fā)表在四月十八日的Nature Methods雜志上,文章通訊作者是MD安德森癌癥中心的助理教授Ken Chen博士和Nicholas Navin。
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新一代測序技術(shù)(NGS)大大增進了我們對疾病(比如癌癥)的理解。不過NGS的研究對象是細胞群體,會掩蓋細胞之間的異質(zhì)性。正因如此,單細胞測序(SCS)技術(shù)受到了越來越多的關(guān)注。
德克薩斯大學(xué)MD安德森癌癥中心的研究人員開發(fā)了首個用于單細胞DNA測序的突變檢出程序,Monovar。這一重要成果發(fā)表在四月十八日的Nature Methods雜志上,文章通訊作者是MD安德森癌癥中心的助理教授Ken Chen博士和Nicholas Navin。Chen博士本科畢業(yè)于清華大學(xué),隨后在Illinois大學(xué)取得博士學(xué)位。
單細胞測序技術(shù)對許多生物學(xué)領(lǐng)域產(chǎn)生了很大的影響,包括癌癥研究、神經(jīng)生物學(xué)、微生物學(xué)和免疫學(xué),大大推動了人們對腫瘤特性的認(rèn)識。不過研究者們一直缺乏在單細胞測序數(shù)據(jù)中準(zhǔn)確檢測單核苷酸變異(SNV)的工具。“為此我們開發(fā)了Monovar,”Nicholas Navin博士說。“Monovar是一種新統(tǒng)計方法,能夠利用多個單細胞的數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)SNV。”
研究人員認(rèn)為Monovar是單細胞測序評估SNV的一大進步,能夠為人們提供多種疾病的關(guān)鍵信息。精確檢測SNV對于癌癥診療、個性化醫(yī)療和產(chǎn)前診斷非常重要,而Monovar在這些方面有著廣闊的應(yīng)用前景。
單細胞基因組學(xué)領(lǐng)域近年來發(fā)展得非常迅速,為人們揭示了復(fù)雜生物學(xué)體系的許多重要線索,包括微生物群落的生態(tài)多樣性和人類癌癥的基因組。一月二十五日Nature Reviews Genetics雜志發(fā)表的一篇重要綜述,全面介紹了單細胞基因組測序的發(fā)展現(xiàn)狀。文章的通訊作者是著名科學(xué)家、斯坦福大學(xué)生物工程系主任Stephen R. Quake。
細胞間差異和異質(zhì)性是干細胞群體固有的基本特性。如果我們對一群細胞進行組學(xué)分析,這些關(guān)鍵的信息就會被掩蓋。單細胞測序技術(shù)可以在同種干細胞中全面剖析細胞異質(zhì)性,鑒定不同表型的細胞。北京大學(xué)的研究員湯富酬和文路在四月十五日的Genome Biology雜志上發(fā)表文章,深入淺出的介紹了干細胞生物學(xué)研究中的單細胞測序技術(shù)。